Du terrain au laboratoire de référence : Développement et évaluation d’un protocole pour l’envoi à faible coût et sans risque infectieux de prélèvements issus de cas suspects de fièvre aphteuse
Résumé
La fièvre aphteuse (FA) est une maladie virale affectant les artiodactyles. L’agent responsable est un Picornavirus du genre Aphtovirus. La caractérisation des souches à l’origine de chaque nouvelle épizootie est importante pour le contrôle de la maladie et notamment pour le choix de la souche vaccinale à utiliser. Cependant, le coût d’expédition des échantillons depuis le terrain vers les laboratoires de référence (LR) sous carboglace et en triple emballage reste un frein à l’identification des souches circulantes. Nous avons développé et évalué au laboratoire un protocole permettant l'expédition de ces échantillons, à température ambiante, sans risque infectieux (Romey et al., 2017), basé sur l'inactivation chimique du virus sur des dispositifs de tests rapides de terrain (LFD). La présente étude, vise à évaluer l'ensemble du processus (du terrain au LR) à partir d’échantillons fraîchement prélevés. Des prélèvements cliniques ont été collectés au Nigeria, en Turquie et au Pakistan et testés sur le terrain en utilisant des LFD. Les LFD positifs, chimiquement inactivés ont permis ultérieurement la détection, la caractérisation moléculaire et la ré-obtention du virus après transfection chimique du génome viral en cellules sensibles. Cette étude contribuera à démontrer que l'utilisation des LFD, couplée à une étape d’inactivation virale, est un moyen de transport, sans risque infectieux, des échantillons de virus aphteux provenant de zones d’endémie pour la caractérisation du virus au laboratoire.
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